黄曾源是长乐琴江村人，字石孙，号立午，晚年号槐瘿。其先祖是辽东铁岭人，从龙入关，编入到汉军正黄旗。国初时其祖希宣公因为军功，官至副都统，驻防福州。于乾隆二十八年迁居闽县洋屿乡，传到黄曾源已经有十余代。他的祖父恩贵公始以道光丁酉举于乡，官至新宁县知县，有一定政绩。其父运昌官至福建云霄同知。

　　公出生于将门之家，生性慷慨，胸怀大志。到弱龄时，便得到黄漳浦先生指点，当先生细读他的文章，发出赞美之声并仰幕他的志向。他于光绪戊子考中举人，于庚寅考中进士，后入选翰林院，办理过淸祕堂事务，撰文处行走，国史馆协修，会典馆篡修，方略馆篡修，功臣馆篡修，在光绪年间京城官员考核中他被评为一等，后来擢升为监察御史，署给事中，历掌山东、江南、四川、河南道，督理衔御史。他没有什么背景，完全凭借自己能力，不到几年，就提拔到重要岗位。他感激于朝廷恩遇，以文章气节来报效答国家。他的座师如翁文恭、李文正、潘文勤、王文敏、李文诚、孙文慤、黄潄兰侍郎、汪柳门侍郎，都是一些有名望之人，他们对黄曾源交相引誉。

　　当甲午中日战争起，朝廷有意放弃台湾，以促成议和。黄曾源洞察时势，向上疏请《计权利害审慎邦交略》，文中说：“如果以台湾给日本，则其势力不断扩张，将是中国日后之患。与其弃台于日本，还不如让它成为各国公共租界地。又进言：“新进者勿贪功，而轻尝试，成事者勿畏事，而废调缪谋。主外者，外瞻循，而忘后患。主内政者，勿铺张，而昧终图”。当时人们都以之名言。当庚子拳匪，为朝廷所用，很多人都表示赞同，因为如果稍有异议可能会惹祸上身。但是黄曾源上奏时执言侃侃，不为威怵，所想很周全。等到两宫西幸，独留京师，与诸王公大臣一起奔走擘画，传递消息。他的《请回銮一疏》，是关系宗社大计。车驾还京时，两宫即日召见，温谕垂询，他痛哭流泪。事宁，臣工都在说变法，唯有他独发表宜详求治理变法，以实不以名的观点---法不变则弱，弱必亡，变而不得道，其道必乱，乱亦亡。数十年之后，他的话真应验，清朝真的毁于变法不得其道。黄曾源居谏垣五年，所上奏的折子有数十篇，所弾劾者，都是高官王公权贵之人，直声凛然。与中江王病山、泸州高城南，同时有三谏之目。后来因为憨直得罪权贵，外放徽州知府，未几变法之诏下，废科举，设议院，常常感觉国家将灭亡。嗣补山东青州知府，调济南府知府，因为河防劳绩，保举为侯补道员。但是国事日非，孑然孤立，回顾同朝为官都是一批新进少年，相互倾扎没有古人品德。黄曾源非常痛恨这种行为，就称疾隐去。到武昌变作，山左易帜，黄曾源先期隐居在岛上矣，㫌迁青州，再徙往青岛。

　　黄曾源独居深念二十年如一日，于1935年十月廿四日卒，享年七十有九。黄曾源刚肠疾恶，好直言，坦白无城府，推城接物持一心。东海徐荫轩相国公，是黄曾源的座师也，曾经因为谕拳匪事，向上表达不同看法，结果失去皇太后的欢心。等到相国死，黄曾源独自一人于围城中奔走，替他的恩师哭丧送行。一人做到这样，皆源于他天性敦笃。就如他少年时遭遇丁家难，一人抚育他的弟弟们，一直到他们成家立业。黄曾源曾经说过：“生平百无一能，性立志坚定”，他深知穷悴容易失去上进的心，意志消沉。其父倾家急难，欠下官府和私人不少钱，数目巨大，所以到黄曾源掌家时什么都没有，且很多上门讨账者，但是他在学习没有半点松懈，更加勤奋，最后以发名成业。在京师为官十年，青鞋布袜，一直致力于学问，就是那些寒士看到，也自叹不如。晚年遭遇世变，谿刻自处，流离颠沛，有“凛然三军不可夺之志”。可谓是一个真君子啊！